ESTUDO DAS LINHAGENS DE SARS-CoV-2 CIRCULANTES NA REGIÃO AMAZÔNICA E IDENTIFICAÇÃO DE POLIMORFISMOS NO ESTADO DO AMAPÁ

Resumo

O objetivo desse trabalho foi avaliar a diversidade das linhagens de SARS-CoV-2 circulantes na região amazônica entre março de 2020 a agosto de 2021 obtidas através do banco de dados públicos GISAID e o alinhamento realizado pelo software Geneious. A investigação das linhagens foi feita pela plataforma Pangolin. Como resultado foram identificadas no estado do Amapá, 903 mutações, sendo 892 do tipo SNP e 11 do tipo INDEL. No Amapá a linhagem B.1.1.33 foi a única em circulação na fase inicial até dezembro de 2020. A cepa P.2 apresentou prevalência a partir de novembro até o final de janeiro de 2021, sendo substituída por P.1 e suas sublinhagens a partir de fevereiro. Na Guiana Francesa, as linhagens B.1 e B.1.1.33 foram prevalentes até maio de 2020. Em dezembro houve predominância da linhagem B.1.160.25 até fevereiro, sendo suprimida por P.1. A linhagem AY.43 foi prevalente em agosto, suprimindo P.1. No Amazonas as linhagens B.1.1 e B.1.195 foram prevalentes na fase inicial, sendo substituídas por B.1.1.28. Em dezembro esta linhagem é substituída pela VOC P.1. No Pará, a linhagem B.1.1.28 e B.1.1.33 são prevalentes no início da pandemia e a identificação da linhagem P.1 e P.2 circulando desde maio de 2020 sugere falhas no GISAID. Foi possível concluir que apesar de haver períodos de não depósitos de amostras no GISAID, ainda assim é possível analisar os dados existentes e sugerir que a dinâmica de dispersão das linhagens depende de uma vigilância periódica e regionalizada da circulação da cepa SARS-CoV2.